Lage:
Im Herzen des südamerikanischen Kontinents, zwischen den Parallelen 16 und 22 Grad südlicher Länge und den Meridianen 55 und 58 Grad westlicher Breite.

Geographische Fläche:
Das Pantanal erstreckt sich auf einer Region des Brasilianischen Mittelwestens von 189 Quadratkilometern (nach dem Geographischen Lexikon des IBGE), von denen 63% zum Bundesstat Mato Grosso do Sul gehören und 37% zu Mato Grosso.

Höhe:
Eine mittlere Höhe von 110 Metern.

Gefälle:
Zwischen 6 und 12 cm pro Kilometer in ost-westlicher Richtung, und 1 bis 2 cm pro Kilometer in nord-südlicher Richtung.

Temperatur:
Heisses Klima im Sommer, mit mittleren Temperaturen um 32°C – kalt und trocken im Winter, mit einem Mittel um die 21°C – gelegentliche Frosteinbrüche zwischen Juli und August. Der jährliche Niederschlag bewegt sich zwischen 1.000 und 1.400 mm – Dezember und Januar sind die regenreichsten Monate. Im Sommer, zwischen Oktober und Mai, der Regenperiode, ist die Gegend überschwemmt. Man kann das Klima dieser Region auch in vier unterschiedliche Jahreszeiten einteilen:

Trockenheit: von Juni bis September
Steigende Überschwemmung: von Oktober bis Dezember
Höchster Überschwemmungsstand: von Januar bis März
Abfluss: von April bis Mai

Relative Luftfeuchtigkeit:
Zwischen 50% und 60% im Winter, sowie um 80% im Sommer.

Regen:
Sintflutartig von November bis Februar. In diesen Monaten registriert man 150mm bis 300mm. Von Juli bis August (Trockenperiode), zwischen 5mm und 50mm.

Eisenbahnverbindung:
450 Kilometer zwischen Campo Grande und Cuiabá – allerdings gegenwärtig nur für den Gütertransport.

Strassenverbindungen:
BR 163 von Campo Grande nach Cuiabá (Norden)
BR 262 von Campo Grande nach Corumbá (Westen)
BR 274 von Campo Grande nach Porto Murtinho (Südosten)

Hydrographie:
Das bedeutendste hydrographische Becken ist das des Rio Paraguay mit 1.400 km Ausdehnung. Die wichtigsten Zuflüsse des Rio Paraguay sind: Rio São Lourenço (560 km), Rio Miranda (264 km) und Rio Taquari (850 km).